无患子染色体等级优质基因组装成功

最近，在《经济作物与产品》中，中国林业科学研究院亚热带林业研究所林木种质资源研究团队(Industrial Crops & Products)研究论文已经发表了。该研究组装了无患子高质量的染色体等级基因组，分析挖掘了油脂产生的候选基因，开发验证了一套特定的分子标记，为无患子基因组学的研究、种质遗传改良和评价提供了科学论证。

无患子果皮含有皂苷，种仁含油量高，秋叶金黄。它是中国重要的天然清洁原料、生物能源和彩化树种。中国林科院亚林所在国内率先开展无患子种质资源的收集、储存、遗传评估和综合利用。2016年，中国第一个无患子中国林木种质资源库在浙江安吉建成，收集和保存了无患子全分布区的重要遗传资源。

该研究基于库存种质，结合第三代测序和第二代测序技术，完成了无患子染色体等级基因组装。该研究基因组的完整性从83.8%提高到97.64%，并弥补了4931个Gaps，大大提高了无患子基因组的绘制质量。

此外，通过基因注解和对比分析，研究小组发现了6个候选基因，参与调节无患子种仁油脂的生成。该研究还基于全基因组序列，开发了20对多态性高、稳定性强的SSR标志，通过346个无患子遗传资源验证了其可靠性，揭示了无患子及其近缘种遗传关系和丰富的种质资源的遗传多样性。

该研究获得了浙江省农业(树木)新品种选育重大科技项目、国家科技基础资源调查重点、林业行业标准等项目资助。