近日,在国家重点R&D计划、国家自然科学基金等项目的支持下,广州大学教授关跃峰团队与合作伙伴开发了GmSWEET10b优秀基因型,通过AI引导的蛋白质设计与基因编辑相结合,提高了自然界不存在的糖转运能力。然后,在多年的田地试验中,主要大豆品种的含油量稳步提高。相关成果在网上发表于《先进科学》(Advanced Science)。
培育高油高产的大豆是解决我国大豆产业“卡脖子”问题,建立粮食安全基础的战略需求。目前主流的分子育种策略侧重于探索关键基因的自然变异,但基因组中的大量重要功能点尚未形成可利用的优良等位基因,是突破品种改良天花板的瓶颈之一。GmSWEET10a和GmSWEET1010b2个同源蛋白,以调节大豆含油量和子粒大小为例,可以驱动种皮向胚胎的糖分运输,从而增加子粒大小和油分积累。
但是,GmSWEET10a的优秀等位基因在高油种质中几乎是固定的,但是同源基因GmSWEET10b在自然人群中一直缺乏有益的变异,从而限制了大豆含油量的进一步提高。AI驱动的蛋白质设计与基因编辑相结合,有望从零开始改善蛋白质功能,从而改善遗传特性,但这一概念尚未在高等生物改良中得到。
通过AlphaFold的预测,这项研究发现,GmSWEET10a的C端变异可以增强或削弱其转运活性。GmSWEET10a在AlphaFold的指导下,通过基因编辑提高了其含油率。此外,还开发了一种新型的GmSWEET10b单倍型,这种型号在自然界中是不存在的,其糖转运能力可以定向增强或削弱。经多年的田间试验验证实,研制出来在不降低产量的情况下,GmSWEET10b基因编辑大豆的含油量或蛋白质含量稳步增加(在一些实验中略有增加)。通过AlphaFold指导的定制基因编辑技术,大豆的油脂和蛋白质含量有望成为提高大豆质量的有效途径,对于打好大豆种业翻身仗具有重要意义。
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