北京大学第一医院教授杨慧霞研究小组回答了“菌群最初定植和建立”的重要科学问题，基于初步研究，从新的角度客观评价，最终得出“健康怀孕前提下羊膜腔无菌”的结论。相关论文最近在微生物组发表。

菌群的最初定植和建立具有重要意义。它关系到生命的早期发育，特别是免疫、代谢等生理过程，对长期健康也有着深远的影响。传统观点认为，人类菌群定植的起源始于产时，相关研究带来了新的靶点和机遇。

然而，近年来，“产前宫内无菌”的观点受到了挑战。研究表明，胎盘、胎粪和子宫可以检测到菌群，并结合组织中发现的“微生物组学”的组成和功能提出了新的诊断和治疗视角。与此同时，一些学者提出，“菌群”的阳性信号可能来自从材料到检测过程的污染因素，“宫内无菌群定植”已成为一个非常反对的主要科学问题。

过去，研究重点关注羊膜腔内的羊水样本。考虑到妊娠晚期可能出现的临产等因素，研究小组提出了一个新的研究角度：即自产前可追溯到中孕期，通过获得产前检查阶段的羊水样本。

同时，针对高敏感检测低生物量样本，研究小组设置了多种阳性/阴性对照方法，提出以下重要建议：低生物量样本进行菌群测序检测时，需要同时考虑生物学意义、菌群生态因素、母体免疫状态等因素，研究得出结论：健康孕妇孕期羊水无菌，并在《美国妇产科杂志》上发表。

然而，上述研究引起了进一步的探索：中孕期到晚孕期是否有动态变化?孕妇能否通过中孕期羊水样本获得菌群检测的生物标记物?

因此，研究小组从多个维度设置了两个序列来回答问题：序列1探讨“中孕到分娩”健康孕妇羊水的动态变化趋势;序列2侧重于“感染不良分娩结果”的孕妇，探讨中孕期羊水中是否存在特定菌群。

研究人员前瞻性地列入194例中孕期羊水(排除标准为胎儿畸形、感染和两周内使用抗生素)，选择足月未分娩的剖腹产孕妇，并在分娩期间留下51例羊水样本，连同中孕期羊水样本的组成序列1;有22名孕妇感染了不良妊娠结局(早产、组织性绒毛膜羊膜炎)。

结果表明，在需氧或厌氧培养条件下，所有羊水样本均未阳性检测。进一步选择qpcr方法对16S进行检测 rRNA，与粪便和阴道拭子样本相比，所有羊水样本的细菌载量都非常低。与材料提取、DNA提取和扩张的比较相比，检测到的细菌更有可能来自材料提取的步骤。以序列1中孕期羊水为参考，序列2中孕期羊水样本和队列1分娩时细菌载量相对较高。

此外，研究人员还设计了“混合已知菌群组成”的阳性对照，以确定16S RNA检测的可信度和稳定性，在此基础上，比较组间菌群组成的差异，虽然结果提醒羊水多样化增加，阴道拭子菌群组成差异下降，但结合阴性对照分析菌群组成、细胞因子检测没有明显差异，因此，研究进一步证实菌群组成为系统污染，健康妊娠羊水处于无菌状态。

对于序列2，虽然培养没有阳性发现，但16S RRNA测序提醒，妊娠期羊水不同于阴性对照，其特定细菌OTUS组成与阴道拭子没有显著差异。

为了进一步消除假阳性的可能性，研究人员通过去除阴性对照和序列1中孕期存在的菌群，将其纳入同时存在于2个以上羊水样本中的菌群。分析数据发现，解脲支原体占第一位。34周内，孕妇自发早产，胎膜完整，病理提醒组织性绒毛膜羊膜炎。细胞因子检查提醒，与序列1中孕期羊水样本相比，序列2羊水中IL-10明显上升，提醒母体对不同菌群产生免疫反应，中孕期羊水样本的组学检查可能预测不良结果的价值。