研究可预测白血病药物反应及临床结局

最近，中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)研究员陈昌亚和费城儿童医院教授谭凯联合宾夕法尼亚大学David T. 通过单细胞多组学习技术，Teachey团队对96例儿童白血病患者(包括急性髓系白血病AML/急性B淋巴细胞白血病B)数据进行了深入分析-ALLT淋巴细胞白血病/急性T-ALL/MPAL，一种急性混合表型白血病)，首次在不同亚型中广泛存在于HSPC中。-like Blasts亚群，并且建立了分子特征图谱，可以预测化疗反应和临床结果。Blood发表了相关研究。

急性白血病是儿童最常见的恶性肿瘤。虽然近年来根据不同白血病治疗策略的研究取得了显著进展，但患者对预防的反应仍然存在较大差异。个性化治疗的关键是深入了解导致这种差异的分子机制。

以前的研究表明，白血病开始细胞(LICs)它在急性白血病的耐药性和复发性中起着关键作用。然而，不同白血病亚型之间的LICs形状和功能特征存在显著差异。由于目前对LICs的研究大多是基于小鼠模型，因此需要系统地探索LICs在不同白血病亚型中的异质性、可塑性和潜在靶点，依靠患者样本。

所以，研究人员对96例不同儿童白血病患者的骨髓/血细胞样本进行了scRNA-seq和scATAC-对seq信息进行整合分析，发现在各种白血病亚型中都有一种原始细胞状态，即HSPC。-like blasts。它在不同亚型中的频率是不同的，在B-ALL中也与特定的分子亚型有关。小鼠移植试验进一步证明了亚群患有白血病的能力。

随后，研究人员对HSPC进行了探索-like blasts是否与各种白血病的化疗抵抗有关。HSPC-like 在AML和T-ALL患者诱导治疗结束后，blasts频率与各种疾病风险指标相关，发现HSPC。-like 细微残留疾病的频率和频率(MRD)标准具有很强的正相关性。通过HSPC-like blasts和Lineage-like blasts对差异基因进行了分析，识别了一组泛白血病HSPC。-like 分子标志物blasts。与其它细胞群相比，HSPC-like blasts有独特的分子标志物，HSPCC可以通过这种泛白血病来治疗。-like blasts的特点是对病人的预后进行精确分层。

进一步结合scRNA-seq和scATAC-在HSPCC中，seq数据分析研究识别了6个。-like 关键转录因子在blasts中普遍上涨(例如HOXA3/5/9、AP-1、CEBPA)，并且建立了包括45个靶基因在内的关键TRN网络。

最后，研究人员通过HSPC将HSPC-like 与公共药物靶点和功能数据库相比，blasts的特性基因选择了top30备选靶基因。在这些目标中，FLT3和BCL2是最高分数的潜在目标。体外药物实验证实，HSPC是6种针对这些目标的药物-like blasts有很好的杀伤效果。

研究人员表示，这项研究首次系统地从多组学习中分析了HSPC-like blasts通过生物信息预测与功能验证相结合，识别了治疗靶点和潜在药物，是儿童急性白血病中常见的性及其功能特征。为了了解白血病的异质性，提高治疗精度，促进临床转化提供了新的思路和技术路径。